때는 1999년. 에도시대 소방사를 선조로 두고 있는 타츠미가의 다섯 남매는 선조의 뜻을 이어받아 지금도 사람들의 생명을 지키는 일을 하며 살아가고 있다. 하지만 어느날, 남매들이 일시에 퇴직처리 되어버리는 일이 생기고, 그들의 앞에 8년전에 행방불명된 아버지 타츠미 세카이가 나타난다. 사실 세카이는 대마신 그랑디누를 강림시키려 하는 사악한 일족인 '재마일족'의 존재를 눈치채고 그들과 싸울 힘을 기르고 있었던 것이다. 이날 하늘은 먹구름으로 뒤덮이고 세계 각지에서 기이한 천재지변이 일어난다. 세카이는 다섯 남매를 자신이 직접만든 비밀집단 '타츠미 방재연구소'로 불러들여 그들에게 안티 해저드 슈트를 부여, '구급전대 고고 파이브'로 임명한다. 고고 파이브는 재마일족의 야망을 막고 사람들을 지키기 위해 싸우기로 결심한다.