남쪽의 섬 미드가르는 드래곤의 힘을 지닌 이능력자, 통칭 ‘D’를 가르치는 학교이다. 그런데 어느 날, 이곳에 세계 유일의 남자 D, 모노노베 유우가 전학 오는데... 유우는 그곳에서 이 학교의 진짜 목적을 알게 된다.