사랑하는 가족이 있고, 친구가 있고, 때로는 웃고, 때로는 운다 그런 어디에나 있을 법한 일상. 미타키하라 중학교에 다니는 보통의 중학교 2학년 카나메 마도카도 그런 일상 속의 한 사람. 어느 날, 그녀에게 신비한 만남이 찾아온다. 이 만남은 우연인가 필연인가 그녀는 아직 알 수 없다. 그것은, 그녀의 운명을 바꿔 버릴 것 같은 만남. 그것은, 새로운 마법소녀 이야기의 시작.