본작은 '슈퍼로봇대전'의 이름을 사용한 첫 애니메이션 작품이다. 다만, OG시리즈의 스토리이기 때문에, 판권 작품 등은 등장하지 않는다. 「슈퍼 로봇 대전 ORIGINAL GENERATION2」종료 후의 이야기이며, 거기서 일어난 「바르톨 사건」을 그리는 오리지널 스토리.