젊은 나이에 수녀원장 자리에 오른 클로다 수녀는 다섯 명의 수녀들을 이끌고 히말라야 산중의 외딴 궁전 모푸로 파견된다. 현지 장군이 기증한 이 궁전은 한때 선대가 후궁들을 거처하게 했던 곳으로, 벽마다 관능적인 그림이 남아 있고 절벽 끝의 종탑 아래로는 아득한 골짜기가 입을 벌리고 있다. 수녀들은 학교와 진료소를 열어 마을 사람들을 돌보려 애쓰지만, 끊임없이 불어대는 바람과 눈부시게 투명한 공기, 낯선 문화 속에서 각자의 마음 깊은 곳에 묻어둔 것들이 하나둘 고개를 든다. 무뚝뚝하지만 거침없는 영국인 대리인 딘은 수녀들의 유일한 조력자이자 가장 위험한 존재로 다가오고, 예민하고 불안정한 루스 수녀는 그를 향한 감정을 억누르지 못한 채 서서히 무너져 간다. 클로다 역시 수녀가 되기 전 고향 아일랜드에서의 사랑을 되새기며 흔들리는 가운데, 산 위의 작은 수녀원은 신앙과 욕망, 헌신과 질투가 소리 없이 충돌하는 전장이 되어가는데...