우주전쟁의 기억과 ‘건담’이 잊힐 정도로 시간이 지난 시대. 귀족주의를 내세운 ‘코스모 바빌로니아’의 반란 앞에 지구연방은 무너지고, 보다 못한 소년 시부크는 시험제작기 ‘F91’에 타고 전장을 향한다.